南北朝分裂结束后，再次建立起一个大一统的朝代隋朝，其统治者也很重视医学。隋炀帝不但创办了太医署，还下令编撰了《四海类聚方》《诸病源候论》等篇幅巨大的医书。

　　《诸病源候论》由太医博士巢元方负责编撰，是我国医学史上内容最为丰富的探讨病因病机和证候的一部专著。全书共50卷，分67门，载列证候1700余条，分别论述了内、外、妇、儿、五官等各科疾病的病因、病理和证候。隋以前，两晋南北朝的医学较为重视对每个病的治疗方药的搜集，而对医学理论的研究较为忽视，《诸病源候论》不仅填补了这一空白，也是继《黄帝内经》之后医学基础理论著作的新成就。

　　《诸病源候论》在对病因的认识上，突破了前人的学说。例如，书中确认了疥疮等病的病原体是疥虫，还认为寄生虫病与饮食卫生有很大关系。书中也记述了不少有关治疗创伤的外科手术方法和缝合理论，还在中毒与毒物分析等方面有着许多新的记载。如书中最早系统地记载了乌头、钩吻等中药的中毒症状，其描述与现代医学的观察基本一致。